COVID-19, известный с начала 2019 года, продолжает мутировать, производя многочисленные штаммы вируса SARS-CoV-2. Болезнь, вызванную различными штаммами, обсуждают медики и общественность, поскольку она вызывает много вопросов. Мы ответим на наиболее важные вопросы, связанные с генетическими вариантами коронавируса.

В микробиологии термин "штаммы" используется для описания культур, полученных из одного и того же источника и в одном месте в одно и то же время. Однако культуры, полученные из того же источника, но в разное время, могут иметь разные штаммы. Хотя микроорганизмы разных штаммов могут принадлежать к одному виду, они различаются между собой. Внутривидовые различия несущественны.

Как пример можно привести коронавирус. Вирус SARS-CoV-2 - виновник последней пандемии COVID-19 - является одним из многих коронавирусов. За время пандемии образовалось несколько штаммов SARS-CoV-2. Эти штаммы различаются между собой геномом, то есть набором генов.

Важно отметить, что вирусы, в том числе и SARS-CoV-2, не являются клетками, а являются носителями генетической информации. Они имеют особую структуру - вирусная частица окружена капсулой и внешней оболочкой, а внутри капсулы находится одна или две молекулы нуклеиновой кислоты. Коронавирус является одноцепочечным РНК-содержащим. Его геном закодирован в единственной молекулярной цепи рибонуклеиновой кислоты.

Штаммы образуются в результате генных мутаций, когда дочерние вирусы немного отличаются от родительских по генетическим характеристикам. Штаммы коронавируса отличаются друг от друга по скорости распространения и клиническим проявлениям инфекционного заболевания. Благодаря генетической изменчивости коронавируса образуется устойчивость к иммунной системе и медикаментозным препаратам.

В данной статье мы ответили на основные вопросы, связанные со штаммами коронавируса, их опасностью и мерами предосторожности.

В соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения, каждый штамм коронавируса SARS-Cov-2 имеет буквенное обозначение на основе греческого алфавита: от альфа до омикрона. Ранее, штаммы коронавируса получали названия, связанные с местом их первого выявления, например, "британский" или "индийский". Такая классификация, однако, несет в себе негативную окраску, связанную с географической привязкой и может вызвать обвинения в адрес всей страны в распространении COVID-19.

С учетом политкорректности, ВОЗ предложила новую номенклатурную классификацию, основанную на греческом алфавите. При этом, старые названия штаммов коронавируса все еще могут использоваться в медицинских исследованиях. Таким образом, к началу 2022 года количество штаммов коронавируса, которые отличаются от первого, китайского варианта, составило 13.

Однако, даже в новой классификации можно обнаружить нюансы. Наиболее известным сейчас является штамм "омикрон". В его названии пропущены буквы ню и кси, которые должны были предшествовать букве омикрон. По мнению экспертов, букву ню пропустили, чтобы не вызывать панику среди жителей англоязычных стран, где слово "new" (англ. новый) звучит так же, как и "ню" (греч. ню). От буквы кси также отказались, поскольку она связана с китайской фамилией Си, которая носится лидером этой страны Си Цзиньпинь. Некоторые источники ранее бездоказательно обвиняли Китай в создании и распространении коронавируса, и ассоциация названия штамма с фамилией главы государства могла бы инициировать антикитайские настроения.

Опасные штаммы коронавируса COVID-19 можно определить по нескольким критериям. Во-первых, опасные штаммы обладают высокой контагиозностью - они легко передаются от человека к человеку. Во-вторых, эти вирусы имеют высокую вирулентность и могут вызывать патологические изменения в тканях организма даже в малых количествах. В-третьих, опасные штаммы характеризуются тяжелым течением коронавирусной инфекции и высокой вероятностью опасных осложнений и неблагоприятного исхода болезни. В-четвертых, возбудители этих штаммов устойчивы к действию вакцин и лекарств.

Организация ВОЗ подготовила список вариантов коронавируса, вызывающих опасения, который получил название VOC (Variants of Concern). В список вошли четыре коронавирусных штамма: альфа-штамм коронавируса, который был обнаружен в Великобритании, штамм из Южной Африки под названием бета-штамм, бразильский гамма-штамм и индийский дельта-штамм. В ноябре 2021 года ВОЗ дополнила список новым штаммом - омикрон. Также был разработан список генетических вариантов, вызывающих интерес (VOI - Variants of Interest), в который вошли штаммы с мутациями генома, которые в будущем могут привести к изменению эпидемиологических характеристик коронавируса. В список VOI вошли штаммы: эта-, йота-, каппа- и лямбда-штаммы. Если количество заболевших этими штаммами возрастет, ВОЗ переведет их из VOI в категорию VOC.

Как проявляется COVID-19, вызванный дельта-штаммом, и в чем его отличие от классического коронавируса?

Дельта-штамм коронавируса, выявленный в Индии, имеет более короткий минимальный инкубационный период, чем классический коронавирус, изначально обнаруженный в городе Ухань. Максимальный период инкубации по-прежнему составляет две недели.

Помимо стандартных симптомов COVID-19, таких как кашель, лихорадка, потеря обоняния и вкуса, дельта-штамм вызывает симптомы, характерные для расстройства желудочно-кишечного тракта, такие как тошнота, рвота и диарея. При этом встречаются боли в голове и горле. Самой уязвимой группой при заражении дельта-штаммом является молодежь в возрасте от 14 до 29 лет.

Источник: Роспотребнадзор. 2021. "Дюжина вопросов о «дельта»-штамме". Доступно по ссылке.

Переписка о дельта-штамме коронавируса становится все более актуальной.

Данный индийский штамм представляет серьезную опасность, поскольку передается значительно легче и быстрее, чем классический COVID-19. Если в случае последнего каждый больной мог заразить 2-3 человека, то в данном случае этот показатель увеличился до 5-8. Вирус имеет особенности клинического проявления, которые способствуют распространению инфекции даже тогда, когда заболевший еще не знает о своем состоянии. Например, первым симптомом может быть высокая длительная температура, что может быть неочевидно для зараженного.

Но опасность дельта-штамма заключается не только в его легком распространении. Этот штамм вызывает более высокую вирусную нагрузку в организме человека. На ее нейтрализацию требуются большие количество антител, что делает болезнь более тяжелой и увеличивает вероятность госпитализации. Особенно тяжело инфекция протекает при заражении новой модификацией - дельта-плюс коронавирусом.

Ситуация с дельта-штаммом коронавируса остается серьезной и требует максимальной внимательности.

Что отличает британский вариант коронавируса от SARS-CoV-2?

Сравнительно с классическим китайским вариантом, симптомы британской коронавирусной инфекции проявляются чаще и с большей степенью выраженности. Например, боль в горле и кашель чаще отмечаются при альфа-штамме. Но утрата обоняния происходит реже - только у 39% пациентов.

Кроме того, вирус на 90% более заразен, а болезнь протекает более тяжело. Частота госпитализации в случае заражения альфа-штаммом выше на 64%, повышая риск неблагоприятного исхода.

Но к счастью, на территории РФ уровень заболеваемости британским штаммом не так высок. В целом, хочется отметить, что на сегодняшний день выделены несколько вариантов коронавируса - альфа, бета, гамма, дельта - и они отличаются друг от друга по структуре и способности заразить человека.

Что известно о новом штамме коронавируса омикрон?

В ноябре 2021 года был обнаружен новый южноафриканский штамм коронавируса, который вызвал большой рост заболеваемости во всем мире. Новая инфекция характеризуется высокой степенью заразности и каждый день устанавливает новые антирекорды. В отличие от предыдущих штаммов, которые преимущественно поражали пожилых людей и тех, у кого были сопутствующие заболевания, новый вирус может заражать даже детей.

В настоящее время нет единого мнения о том, насколько тяжело протекает заболевание и какова вероятность смертельного исхода. Согласно проведенным лабораторным исследованиям, омикрон-штамм реже проникает в легкие и вместо этого чаще поражает носоглотку. Это может быть одной из причин пиковой заболеваемости. Однако, количество смертей все еще находится на уровне от 0,1% до 0,2% и не выше, чем у предыдущих штаммов.

Дополнительную информацию о новом штамме коронавируса омикрон можно найти в статье биолога Константина Северинова "10 вопросов об омикрон-штамме", которую можно найти по ссылке: https://trends.rbc.ru/.

Как понять, что вы заболели одним из вариантов коронавируса? Это вопрос, на который чрезвычайно важно знать ответ в наше непростое время. Каждый штамм вируса имеет свои особенности. Некоторые варианты могут вызывать болезнь с легким течением, а другие - гораздо более опасные последствия. Также существуют штаммы, которые нападают на конкретную возрастную категорию, в то время как другие могут поразить любого человека.

Когда вы подозреваете, что заболели, учитывать все особенности вируса не стоит. Поэтому объективная диагностика является важной процедурой для определения генетического варианта SARS-CoV-2. Для этого специалисты проводят полимеразную цепную реакцию (ПЦР) с последующим секвенированием, то есть изучением вирусного генома в лабораторных условиях. В результате исследования можно определить последовательность генов в молекулярной цепи. Сложное оборудование, используемое при диагностике, требует специальной квалификации. Однако сама процедура взятия мазка из носоглотки и ротоглотки проста и может быть выполнена как в клинике, так и на дому. Результат ПЦР готов через несколько часов и считается практически абсолютно достоверным. По этой причине, ПЦР является «золотым стандартом» для диагностики инфекции COVID-19.

Это первая отечественная тест-система для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2, и ее разработка была описана на информационном портале о генетике GENETICS.

Сохраняя структуру текста, перепишем его таким образом:

Как действует иммунитет у человека, перенесшего коронавирус? Станет ли он защищен от других штаммов?

После заболевания в кровотоке человека появляются антитела к коронавирусу. Если повторное заражение происходит, они начинают бороться с вирусом. Однако мутации SARS-CoV-2 могут затруднить борьбу с вирусом, даже при наличии антител. Кроме того, вирус может быть уничтожен не только антителами, но и другими компонентами иммунной системы. В связи с этим, нельзя предсказать, будет ли иммунитет эффективен в каждом отдельном случае.

Стоит учитывать, что временной фактор может оказать влияние на иммунитет. С течением времени количество циркулирующих антител в крови уменьшается, что ведет к снижению защитных свойств организма. Поэтому ответить четко на вопрос не удается. Эффективность иммунитета может варьироваться и зависеть от многих факторов, включая вид мутации, время повторного заражения и общее состояние иммунной системы.

Фото: freepik.com